台湾当选总统马英九挑选了一位来自具有台独倾向政党的前立法委员来执掌负责两岸关系的内阁机构，从而给两岸关系改善的前景增添了变数。

马英九指定的行政院长人选刘兆玄昨日宣布，在马英九5月20日就职后，具有台独倾向的台湾团结联盟前立委赖幸媛将出任陆委会(Mainland Affairs Council)主委。

两岸关系专家警告称，此举可能妨碍马英九密切与中国大陆经济联系的计划。国民党内部支持与大陆建立更紧密联系的人士对这一决定提出挑战，而一些接近即将下野的民进党政府的观察人士则对此加以嘲讽。

两岸关系专家、台北中国文化大学(Chinese Culture University)教授蔡玮表示：“或许这是为了安抚台独阵营，因为部分民众担心国民党政府接近中国大陆的速度过快，走得太远。但任命这样一位强硬派人士，可能会让北京怀疑马英九在推动两岸更紧密关系方面的诚意，导致中国大陆领导人放慢步伐。”

一位国民党政界人士表示，党内领导层对马英九的选择感到“震惊”，特别是他没有事先告知他们。

从理论上讲，赖幸媛将主管与中国大陆之间的所有谈判，因为台湾的两岸关系主要谈判方海基会(Straits Exchange Foundation)负责人，要向陆委会主委汇报。

新任命的海基会董事长江丙坤已制订了迅速恢复两岸对话的计划。但赖幸媛出任陆委会主委，将给上述计划的施行带来问题。

赖幸媛毕业于伦敦经济学院(London School of Economics)，在处理两岸关系方面拥有丰富经验。她还以一位强硬的谈判者著称，不回避冲突。在担任立委期间，她把精力集中在保护台湾本土经济免受中国大陆冲击方面 ，有一次曾发起一场激进的活动，游说政府对廉价大陆毛巾设置进口壁垒。